Het thema van het tweede seizoen is 'tijd': de wisselende seizoenen, het verschil tussen weekend en doordeweekse dagen, en de overgang van nacht naar dag. Hoe speelt dit door in de nieuwe animaties?

In datavisualisaties worden dingen zichtbaar die je vanuit de helikopter niet kunt laten zien. Bijvoorbeeld de bouw van de nieuwe maasvlakte, die over de loop van jaren aangelegd werd.

In het tweede seizoen gebruikt Nederland van Boven meerdere databronnen om een verhaal te vertellen. Bijvoorbeeld dat van een sneeuwstorm, dat voor een dag heel Nederland stil legde.

Waar het eerste seizoen overwegend positieve verhalen vertelde, is er nu ook plaats voor de kleine tragiek in Nederland. Neem het verhaal van een wespendievenechtpaar, dat elkaar in een storm in Afrika uit het oog verloor.