Zaterdag 18 februari onthulde Argos dat het College van Bestuur van de Universiteit Tilburg bij het Openbaar Ministerie aangifte tegen de oud-hoogleraar heeft gedaan wegens verduistering en valsheid in geschrifte.
Het college verdenkt hem ervan grote geldbedragen (in totaal volgens ingewijden meer dan een miljoen Euro) te hebben laten overmaken aan twee bedrijven waar hij familiebanden mee heeft. Hij schakelde die bedrijven in voor de begeleiding van promovendi. Één van die bedrijven is een schoonheidssalon in Gorinchem, dat eigendom is van de partner van een nicht van De Ruijter.
De Ruijter was tot november 2014 decaan van de faculteit Humanities van de Universiteit van Tilburg en sinds maart 2013 directeur van NCDO. Tot oktober 2013 was hij ook nog lector aan de Politieacademie.